Cergentis намерена создать инструмент для мониторинга терапии солидных опухолей

Подготовил Алексей Торгашев

Cergentis намерена вывести новый продукт на рынок к 2020 году. Технология TLA будет применяться для работы с образцами, фиксированными формалином и залитыми в парафин (FFPE), а на ее разработку компания недавно получила грант в 1,2 млн. евро.

TLA позволяет секвенировать гены полностью и находить структурные перестройки, которые упускаются другими методами (ОТ-ПЦР), и проще в работе, чем применяемый для этих целей метод FISH.

Сейчас TLA используют главным образом фармацевтические компании, например, при исследованиях лейкемии. Однако компания надеется, что после внедрения протокола для работы с FFPE она расширит круг потребителей и выйдет на рынок лабораторий, работающих с солидными опухолями. Также в Cergentis надеются, что развитие метода приведет к созданию полноценных тест-систем для сопроводительной диагностики.

TLA уже сейчас адаптирован к применению на автоматических платформах. Основа технологии: образца формальдегидом для фиксации взаимодействующих участков ДНК и белков с последующей рестрикцией, лигированием и образованием кольцевых фрагментов, затем — очищение лигированных участков от белков, ПЦР фрагментов ДНК, содержащих таргетный ген, и секвенирование. На выходе получаем полную картину генетических изменений в интересующем гене: как точечных мутаций, так и хромосомных перестроек.

Источник

Cergentis Aims to Introduce TLA Kits for Cancer Companion Dx Development